Die Franziskanermönche kamen nach dem Türkeneinfall nach Bratislava und begannen zum Ende des 13. Jahrhunderts an einer Kirche zu bauen. Aus dieser Zeit stammen die Außenwände des Kirchenschiffs und des Presbyteriums. Die einschiffige Kirche hat ein romantisch-gotisches Portal und massive Außenwände. Der Kirchenturm kam am Ende des 14. Jahrhunderts hinzu; baufällig geworden, wurde er abgetragen und im Aupark von Petržalka als Gartenpavillon aufgestellt. Der heutige Turm ist eine Kopie des Originals. Im Jahre 1296 wurde dem hl. Johannes Elemosinarius dem Evangelisten geweihte hochgotische Kapelle nach dem Vorbild der französischen Königskapelle in Paris angebaut.

der Klarissenorden entstand in Bratislava durch den Übertritt der Zisterzienserinnen zum Orden der hl. Clara nach 1297. Es ist eine gotische einschiffige Kirche aus der ersten Hälfte des 14. Jahrhunderts. Der fünfeckige Turm mit dem Figurenschmuck wurde um 1400 erbaut. Heute finden in der Kirche Ausstellungen und Konzerte statt.

Die Katharinenkapelle ließ im Jahre 1311 der Zisterzienser Franz von Colomba in der heutigen Michaelergasse erbauen. Die Kapelle gehörte den Zisterziensern bis zum Anfang des 16. Jahrhunderts, danach den Kapuzinern. Das Innere ist gotisch und die Fassade klassizistisch.